Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PRMT7-204ENST00000561806 543 ntTSL 57.74□□□□□ -1.175e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.187e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-211ENST00000531684 630 ntTSL 57.59□□□□□ -1.191e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GEMIN2-212ENST00000534684 658 ntTSL 37.42□□□□□ -1.221e-12■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.237e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 UQCRC2-204ENST00000563711 2008 ntTSL 27.34□□□□□ -1.241e-13■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 UQCRC2-205ENST00000563898 1406 ntTSL 56.64□□□□□ -1.351e-13■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PIKFYVE-207ENST00000452564 4214 ntTSL 26.62□□□□□ -1.357e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.427e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PRMT7-216ENST00000565761 687 ntTSL 55.48□□□□□ -1.535e-6■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 GK-212ENST00000488296 633 ntTSL 55.04□□□□□ -1.67e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.717e-9■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-21■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-21■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.047e-9■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 211.79□□□□□ -0.525e-19■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.275e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.425e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.415e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 TAOK1-205ENST00000583121 526 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.372e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.472e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 TAOK1-206ENST00000587277 353 ntTSL 23.75□□□□□ -1.812e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.224e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.324e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.364e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.544e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-203ENST00000502795 580 ntTSL 413.79□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-209ENST00000510872 577 ntTSL 412.2□□□□□ -0.461e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.121e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 27.94□□□□□ -1.141e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-207ENST00000507863 582 ntTSL 47.72□□□□□ -1.171e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.321e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.931e-6■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 ZCCHC7-204ENST00000463625 732 ntTSL 25.02□□□□□ -1.611e-8■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PIEZO1-203ENST00000419505 1635 ntTSL 1 (best)19.75■□□□□ 0.752e-13■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.164e-7■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PIEZO1-211ENST00000495568 901 ntTSL 210.53□□□□□ -0.722e-13■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PIEZO1-204ENST00000466823 584 ntTSL 28.19□□□□□ -1.12e-13■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 PRAME-204ENST00000403441 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.36□□□□□ -0.431e-15■■■□□ 16.5
ILF3Q12906 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-10■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 NEDD9-204ENST00000448183 4934 ntTSL 1 (best)7.6□□□□□ -1.193e-10■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.313e-10■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.333e-10■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.373e-10■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SUZ12P1-205ENST00000582329 785 ntTSL 54.41□□□□□ -1.74e-9■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 LONP1-204ENST00000586617 471 ntTSL 525.45■■□□□ 1.663e-8■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 LONP1-205ENST00000587365 641 ntTSL 523.82■■□□□ 1.43e-8■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MPV17L-203ENST00000564148 529 ntTSL 418.23■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.154e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -04e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-204ENST00000311420 1583 ntTSL 510.69□□□□□ -0.74e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-222ENST00000523991 505 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.024e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-213ENST00000393417 1683 ntTSL 57.56□□□□□ -1.24e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-225ENST00000539479 845 ntTSL 1 (best)6□□□□□ -1.454e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-211ENST00000393415 842 ntTSL 55.96□□□□□ -1.464e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-220ENST00000496959 897 ntTSL 1 (best)5.4□□□□□ -1.544e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-224ENST00000537182 1011 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.554e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.64e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-230ENST00000543323 427 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-234ENST00000546048 363 ntTSL 54.97□□□□□ -1.614e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-226ENST00000540352 1315 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.684e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-228ENST00000542502 1127 ntTSL 1 (best)4.28□□□□□ -1.724e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.754e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.774e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-223ENST00000536089 1181 ntTSL 1 (best)3.63□□□□□ -1.834e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-218ENST00000481186 1056 ntTSL 53.63□□□□□ -1.834e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.864e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.884e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.924e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.924e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.924e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.984e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.054e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.064e-7■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 518.24■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 27.23□□□□□ -1.257e-10■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 54.42□□□□□ -1.77e-10■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.121e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-207ENST00000397105 883 ntTSL 220.72■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-210ENST00000428626 567 ntTSL 315.46■□□□□ 0.071e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-213ENST00000445064 669 ntTSL 515.42■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-206ENST00000397102 582 ntTSL 315□□□□□ -0.011e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-212ENST00000432213 594 ntTSL 414.14□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-204ENST00000397099 555 ntTSL 413.91□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 SEC13-205ENST00000397101 592 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 16.4
ILF3Q12906 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-6■■■□□ 16.3
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 165.4 ms