Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA3Q08378 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms