Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms