Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms