Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms