Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms