Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP5P51878 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP5P51878 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP5P51878 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms