Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMPK1P30085 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms