Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF4P18848 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF4P18848 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF4P18848 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms