Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms