Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGA3P0DJD8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms