Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms