Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF1O43189 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF1O43189 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF1O43189 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF1O43189 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF1O43189 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms