Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms