Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN8O00124 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms