Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC160A6NGH7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms