Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms