Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEF1Q9UBV8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms