Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.825e-10■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 KIAA1328-206ENST00000590617 1835 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.045e-10■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.295e-10■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-213ENST00000581825 793 ntTSL 313.8□□□□□ -0.25e-13■■■■■ 188
UTP3Q9NQZ2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 187.9
UTP3Q9NQZ2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.014e-10■■■■■ 187.9
UTP3Q9NQZ2 TECPR1-209ENST00000472845 551 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 187.9
UTP3Q9NQZ2 TPTE2P2-203ENST00000605936 1003 ntTSL 516.42■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 187.8
UTP3Q9NQZ2 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.298e-7■■■■■ 187.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 319.05■□□□□ 0.649e-10■■■■■ 187.8
UTP3Q9NQZ2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 319.73■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 RSBN1-203ENST00000476412 3772 ntTSL 211.33□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 FDXR-212ENST00000580492 553 ntTSL 521.2■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 520.65■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 419.22■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 418.8■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 417.97■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 187.7
UTP3Q9NQZ2 SLC23A2-204ENST00000468355 1934 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-208ENST00000389632 959 ntTSL 515.38■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-209ENST00000428161 961 ntTSL 214.68□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 TEX264-211ENST00000463857 3937 ntTSL 1 (best)13.79□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 411.69□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-8■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 PLA2G4B-205ENST00000566076 379 ntTSL 210.04□□□□□ -0.81e-9■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.17e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 SS18-224ENST00000584083 663 ntTSL 421.78■■□□□ 1.086e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 SS18-218ENST00000581021 588 ntTSL 421.55■■□□□ 1.046e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 SS18-209ENST00000578595 406 ntTSL 320.89■□□□□ 0.936e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 SS18-208ENST00000577751 580 ntTSL 420.61■□□□□ 0.896e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.096e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 AL157392.5-201ENST00000601460 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.66e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 AL157392.5-202ENST00000595538 732 ntTSL 59.95□□□□□ -0.826e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 COX7A2L-206ENST00000468711 516 ntTSL 39.51□□□□□ -0.896e-16■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 187.5
UTP3Q9NQZ2 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-13■■■■■ 187.4
UTP3Q9NQZ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 187.4
UTP3Q9NQZ2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 187.4
UTP3Q9NQZ2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 187.4
UTP3Q9NQZ2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 187.4
UTP3Q9NQZ2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 187.4
UTP3Q9NQZ2 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 317.36■□□□□ 0.379e-11■■■■■ 187.4
UTP3Q9NQZ2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 01e-6■■■■■ 187.3
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 187.3
UTP3Q9NQZ2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-12■■■■■ 187.3
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 187.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 187.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 187.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 187.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 187.2
UTP3Q9NQZ2 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 187.2
UTP3Q9NQZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 187.2
UTP3Q9NQZ2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 187.1
UTP3Q9NQZ2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 187.1
UTP3Q9NQZ2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 187.1
UTP3Q9NQZ2 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 511.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 187.1
UTP3Q9NQZ2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 187
UTP3Q9NQZ2 USP7-208ENST00000563961 4533 ntTSL 515.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 187
UTP3Q9NQZ2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 186.9
UTP3Q9NQZ2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 186.9
UTP3Q9NQZ2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 186.9
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-209ENST00000489607 488 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 186.7
UTP3Q9NQZ2 TONSL-202ENST00000497613 6607 ntTSL 218.51■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 186.6
UTP3Q9NQZ2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 186.6
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 517.9■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 186.6
UTP3Q9NQZ2 FHL3-203ENST00000477194 1091 ntTSL 235.53■■■■□ 3.289e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.799e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.559e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PCNX1-206ENST00000554292 402 ntTSL 430.32■■■□□ 2.447e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DUS1L-211ENST00000578907 1084 ntTSL 329.61■■■□□ 2.339e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.299e-7■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DIRC2-202ENST00000477647 1822 ntTSL 1 (best)28.93■■■□□ 2.227e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PURA-203ENST00000505703 597 ntTSL 328.68■■■□□ 2.189e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.147e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PURA-202ENST00000502351 502 ntTSL 228.33■■■□□ 2.139e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FAM120AOS-205ENST00000476484 1491 ntTSL 1 (best)28.12■■■□□ 2.097e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DNAJB2-210ENST00000472019 1419 ntTSL 327.8■■■□□ 2.047e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 REXO4-206ENST00000494045 743 ntTSL 327.75■■■□□ 2.037e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DUS1L-207ENST00000578176 937 ntTSL 527.5■■□□□ 1.999e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.957e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.937e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 REXO4-205ENST00000478037 847 ntTSL 227.05■■□□□ 1.927e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.927e-8■■■■■ 186.3
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