RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477647.1

DIRC2-202, Transcript of disrupted in renal carcinoma 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DIRC2, Length 1,822 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC2-202ENST00000477647 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63■■■■■ 7.68
DIRC2-202ENST00000477647 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.45■■■■■ 6.47
DIRC2-202ENST00000477647 ABCC9O60706 1549 aa53.35■■■■■ 6.13
DIRC2-202ENST00000477647 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.73■■■■■ 6.03
DIRC2-202ENST00000477647 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.33■■■■■ 5.97
DIRC2-202ENST00000477647 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.07■■■■■ 5.93
DIRC2-202ENST00000477647 NACADO15069 1562 aa51.86■■■■■ 5.89
DIRC2-202ENST00000477647 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.83■■■■■ 5.89
DIRC2-202ENST00000477647 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.67■■■■■ 5.86
DIRC2-202ENST00000477647 SCRIBQ14160 1630 aa50.86■■■■■ 5.73
DIRC2-202ENST00000477647 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.66■■■■■ 5.7
DIRC2-202ENST00000477647 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.64■■■■■ 5.7
DIRC2-202ENST00000477647 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.15■■■■■ 5.62
DIRC2-202ENST00000477647 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.07■■■■■ 5.61
DIRC2-202ENST00000477647 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.04■■■■■ 5.44
DIRC2-202ENST00000477647 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.73■■■■■ 5.39
DIRC2-202ENST00000477647 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.72■■■■■ 5.39
DIRC2-202ENST00000477647 SMARCA4P51532 1647 aa48.67■■■■■ 5.38
DIRC2-202ENST00000477647 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.64■■■■■ 5.38
DIRC2-202ENST00000477647 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
DIRC2-202ENST00000477647 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.27■■■■■ 5.32
DIRC2-202ENST00000477647 WIZO95785 1651 aa48.21■■■■■ 5.31
DIRC2-202ENST00000477647 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
DIRC2-202ENST00000477647 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.11■■■■■ 5.29
DIRC2-202ENST00000477647 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.1■■■■■ 5.29
DIRC2-202ENST00000477647 SMARCA2P51531 1590 aa48.05■■■■■ 5.28
DIRC2-202ENST00000477647 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.97■■■■■ 5.27
DIRC2-202ENST00000477647 NCAPD3P42695 1498 aa47.85■■■■■ 5.25
DIRC2-202ENST00000477647 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
DIRC2-202ENST00000477647 HMGXB3Q12766 1538 aa47.73■■■■■ 5.23
DIRC2-202ENST00000477647 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
DIRC2-202ENST00000477647 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.14■■■■■ 5.14
DIRC2-202ENST00000477647 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.55■■■■■ 5.04
DIRC2-202ENST00000477647 NESP48681 1621 aa46.52■■■■■ 5.04
DIRC2-202ENST00000477647 CFTRP13569 1480 aa46.51■■■■■ 5.04
DIRC2-202ENST00000477647 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.42■■■■■ 5.02
DIRC2-202ENST00000477647 PRDM2Q13029 1718 aa46.26■■■■■ 5
DIRC2-202ENST00000477647 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.06■■■■■ 4.96
DIRC2-202ENST00000477647 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.05■■■■■ 4.96
DIRC2-202ENST00000477647 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.98■■■■■ 4.95
DIRC2-202ENST00000477647 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.87■■■■■ 4.93
DIRC2-202ENST00000477647 ABCC8Q09428 1581 aa45.86■■■■■ 4.93
DIRC2-202ENST00000477647 ERCC6Q03468 1493 aa45.84■■■■■ 4.93
DIRC2-202ENST00000477647 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.64■■■■■ 4.9
DIRC2-202ENST00000477647 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.56■■■■■ 4.88
DIRC2-202ENST00000477647 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.56■■■■■ 4.88
DIRC2-202ENST00000477647 CUX1P39880 1505 aa45.55■■■■■ 4.88
DIRC2-202ENST00000477647 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
DIRC2-202ENST00000477647 SYNJ1O43426 1573 aa45.54■■■■■ 4.88
DIRC2-202ENST00000477647 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.88
DIRC2-202ENST00000477647 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.46■■■■■ 4.87
DIRC2-202ENST00000477647 TOPBP1Q92547 1522 aa45.45■■■■■ 4.87
DIRC2-202ENST00000477647 TOP2BQ02880 1626 aa45.42■■■■■ 4.86
DIRC2-202ENST00000477647 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.39■■■■■ 4.86
DIRC2-202ENST00000477647 WDR62O43379 1518 aa45.38■■■■■ 4.85
DIRC2-202ENST00000477647 TRIM41Q8WV44 630 aa45.38■■■■■ 4.85
DIRC2-202ENST00000477647 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.21■■■■■ 4.83
DIRC2-202ENST00000477647 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
DIRC2-202ENST00000477647 CUX2O14529 1486 aa45■■■■■ 4.79
DIRC2-202ENST00000477647 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45■■■■■ 4.79
DIRC2-202ENST00000477647 SOGA1O94964 1423 aa44.96■■■■■ 4.79
DIRC2-202ENST00000477647 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
DIRC2-202ENST00000477647 IFT140Q96RY7 1462 aa44.82■■■■■ 4.77
DIRC2-202ENST00000477647 WDR97A6NE52 1622 aa44.78■■■■■ 4.76
DIRC2-202ENST00000477647 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.78■■■■■ 4.76
DIRC2-202ENST00000477647 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.65■■■■■ 4.74
DIRC2-202ENST00000477647 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
DIRC2-202ENST00000477647 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
DIRC2-202ENST00000477647 KIF27Q86VH2 1401 aa44.57■■■■■ 4.73
DIRC2-202ENST00000477647 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.54■■■■■ 4.72
DIRC2-202ENST00000477647 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
DIRC2-202ENST00000477647 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.53■■■■■ 4.72
DIRC2-202ENST00000477647 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
DIRC2-202ENST00000477647 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.47■■■■■ 4.71
DIRC2-202ENST00000477647 EEA1Q15075 1411 aa44.39■■■■■ 4.7
DIRC2-202ENST00000477647 PBRM1Q86U86 1689 aa44.34■■■■■ 4.69
DIRC2-202ENST00000477647 IGF1RP08069 1367 aa44.27■■■■■ 4.68
DIRC2-202ENST00000477647 GRIN2BQ13224 1484 aa44.27■■■■■ 4.68
DIRC2-202ENST00000477647 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.25■■■■■ 4.67
DIRC2-202ENST00000477647 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.24■■■■■ 4.67
DIRC2-202ENST00000477647 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.13■■■■■ 4.65
DIRC2-202ENST00000477647 CUL7Q14999 1698 aa44.07■■■■■ 4.65
DIRC2-202ENST00000477647 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.03■■■■■ 4.64
DIRC2-202ENST00000477647 ADAMTS12P58397 1594 aa44.03■■■■■ 4.64
DIRC2-202ENST00000477647 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
DIRC2-202ENST00000477647 PRXQ9BXM0 1461 aa44.02■■■■■ 4.64
DIRC2-202ENST00000477647 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.97■■■■■ 4.63
DIRC2-202ENST00000477647 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.95■■■■■ 4.63
DIRC2-202ENST00000477647 KIF21BO75037 1637 aa43.93■■■■■ 4.62
DIRC2-202ENST00000477647 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.89■■■■■ 4.62
DIRC2-202ENST00000477647 SYNJ2O15056 1496 aa43.86■■■■■ 4.61
DIRC2-202ENST00000477647 FBLN2P98095 1184 aa43.8■■■■■ 4.6
DIRC2-202ENST00000477647 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.79■■■■■ 4.6
DIRC2-202ENST00000477647 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
DIRC2-202ENST00000477647 GOLGA3Q08378 1498 aa43.77■■■■■ 4.6
DIRC2-202ENST00000477647 GRIN2AQ12879 1464 aa43.74■■■■■ 4.59
DIRC2-202ENST00000477647 CHD1O14646 1710 aa43.74■■■■■ 4.59
DIRC2-202ENST00000477647 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
DIRC2-202ENST00000477647 CEP170Q5SW79 1584 aa43.52■■■■■ 4.56
DIRC2-202ENST00000477647 NUP160Q12769 1436 aa43.46■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms