Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSU72Q9NP77 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms