Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFGAP3Q9NP61 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms