Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCL3Q9H2J4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms