Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms