Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms