Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms