Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms