Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms