Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY6

MBD3L1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L1Q8WWY6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L1Q8WWY6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L1Q8WWY6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms