Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms