Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 RPS27A-202ENST00000402285 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 RPS27A-210ENST00000495843 1159 ntTSL 58.84□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.511e-6■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.711e-8■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-8■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 515.09■□□□□ 0.011e-8■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-323■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 SSRP1-205ENST00000635721 675 ntTSL 58.23□□□□□ -1.091e-7■□□□□ 9.5
AGGF1Q8N302 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.14e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 312.44□□□□□ -0.424e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 310.78□□□□□ -0.684e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 29.43□□□□□ -0.94e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.134e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.264e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 26.68□□□□□ -1.344e-9■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.072e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.962e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.962e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ELK4-204ENST00000616704 2535 ntTSL 226.65■■□□□ 1.862e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.792e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.592e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-14■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.852e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.551e-14■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ADGRE2-205ENST00000594076 2193 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ADGRE2-204ENST00000392965 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 512.27□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ADGRE2-202ENST00000360222 3330 ntTSL 210.65□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-14■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 KCNMB2-AS1-201ENST00000421498 393 ntTSL 37.01□□□□□ -1.296e-12■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 ELK4-203ENST00000468523 477 ntTSL 36.4□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.479e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 DPP4-204ENST00000434918 2674 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.35e-15■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CRNKL1-204ENST00000490910 4183 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.451e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.55e-15■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 DPP4-207ENST00000490286 2241 ntTSL 511.55□□□□□ -0.565e-15■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 DPP4-202ENST00000413651 578 ntTSL 411.39□□□□□ -0.595e-15■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CRNKL1-206ENST00000521379 673 ntTSL 510.29□□□□□ -0.761e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 DPP4-205ENST00000461836 672 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.875e-15■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 DPP4-210ENST00000497461 781 ntTSL 1 (best)9.6□□□□□ -0.875e-15■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CRNKL1-205ENST00000496549 4093 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.981e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.021e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.068e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 DPP4-203ENST00000416189 527 ntTSL 58.34□□□□□ -1.075e-15■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.091e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CRNKL1-203ENST00000490258 733 ntTSL 24.9□□□□□ -1.631e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SPAG9-215ENST00000513746 822 ntTSL 515.11■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SPAG9-217ENST00000513906 750 ntTSL 58.96□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.167e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.57e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 TAX1BP1-204ENST00000416801 2221 ntTSL 25.64□□□□□ -1.517e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.677e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.817e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.689e-18■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 29.87□□□□□ -0.839e-18■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 XYLB-205ENST00000487569 365 ntTSL 56.63□□□□□ -1.359e-18■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SETD2-209ENST00000638947 1984 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.614e-10■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 NAA15-207ENST00000496716 677 ntTSL 38.87□□□□□ -0.996e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 GOLGA4-211ENST00000498250 560 ntTSL 27.37□□□□□ -1.234e-16■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PPIG-210ENST00000482772 982 ntTSL 57.14□□□□□ -1.276e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.44e-10■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.87□□□□□ -1.474e-10■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.484e-10■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 54.25□□□□□ -1.734e-10■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PFDN4-205ENST00000493356 659 ntTSL 320■□□□□ 0.794e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CAPRIN1-217ENST00000534825 668 ntTSL 317.37■□□□□ 0.374e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CAPRIN1-204ENST00000526494 399 ntTSL 416■□□□□ 0.154e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.054e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.044e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.164e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PFDN4-204ENST00000487129 762 ntTSL 213.75□□□□□ -0.214e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 LRRFIP1-212ENST00000483443 1069 ntTSL 311.97□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 PFDN4-202ENST00000441080 579 ntTSL 58.03□□□□□ -1.124e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 CAPRIN1-214ENST00000533641 429 ntTSL 46.24□□□□□ -1.414e-8■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SMARCC1-204ENST00000462198 785 ntTSL 25.79□□□□□ -1.482e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 SMARCC1-206ENST00000485737 631 ntTSL 45.01□□□□□ -1.612e-7■□□□□ 9.4
AGGF1Q8N302 RFX3-AS1-202ENST00000427722 1088 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.984e-6■□□□□ 9.3
AGGF1Q8N302 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.245e-13■□□□□ 9.3
Retrieved 100 of 9,853 protein–RNA pairs in 409.5 ms