Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 UROS-205ENST00000420761 802 ntTSL 523.69■■□□□ 1.384e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 UROS-206ENST00000462490 3188 ntTSL 58.64□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LRRC20-202ENST00000357631 2906 ntTSL 216.33■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LRRC20-207ENST00000446961 663 ntTSL 213.5□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 WEE1-207ENST00000530712 990 ntTSL 25.98□□□□□ -1.457e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 WEE1-206ENST00000530175 838 ntTSL 35.5□□□□□ -1.537e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 SEPT5-208ENST00000431124 920 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.36e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 CPSF1-204ENST00000529288 588 ntTSL 211.88□□□□□ -0.511e-12■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 516.77■□□□□ 0.285e-10■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ACADVL-219ENST00000579425 1234 ntTSL 513.55□□□□□ -0.245e-10■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 520.96■□□□□ 0.956e-9■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 517.36■□□□□ 0.376e-9■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 C11orf80-212ENST00000531415 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.11■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 AC090004.1-202ENST00000601399 787 ntTSL 510.17□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 INTS10-212ENST00000522081 2333 ntTSL 27.43□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ZNF518A-204ENST00000484770 468 ntTSL 35.81□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ZNF518A-207ENST00000539666 485 ntTSL 45.23□□□□□ -1.574e-6■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 BAZ2A-203ENST00000547453 484 ntTSL 410.22□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 BAZ2A-217ENST00000553222 681 ntTSL 27.93□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ACADVL-229ENST00000582356 633 ntTSL 420.69■□□□□ 0.92e-19■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ACADVL-212ENST00000578421 548 ntTSL 320.03■□□□□ 0.82e-19■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ACADVL-238ENST00000584103 555 ntTSL 419.91■□□□□ 0.782e-19■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ACADVL-223ENST00000580263 545 ntTSL 219.73■□□□□ 0.752e-19■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ACADVL-227ENST00000582056 738 ntTSL 218.12■□□□□ 0.492e-19■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ATP2A3-212ENST00000572694 894 ntTSL 215.63■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 06e-7■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 IARS-208ENST00000472894 651 ntTSL 36.22□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 520.09■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 316.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 NADK-216ENST00000497747 467 ntTSL 215.07■□□□□ 02e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 NADK-215ENST00000497615 534 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 NADK-211ENST00000489538 475 ntTSL 312.54□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 NADK-209ENST00000480499 549 ntTSL 212.11□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 LMNA-225ENST00000515824 393 ntTSL 217.64■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 58.09□□□□□ -1.115e-8■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 521.78■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 TIMM44-212ENST00000600748 768 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.16■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 RHBG-208ENST00000620376 1984 ntTSL 218.77■□□□□ 0.63e-17■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 RHBG-201ENST00000451864 1927 ntTSL 218.68■□□□□ 0.583e-17■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 RHBG-205ENST00000612897 1862 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.153e-17■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-17■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 RHBG-206ENST00000613460 1912 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.193e-17■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 RHBG-207ENST00000618120 2424 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-17■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CHTF18-213ENST00000498439 673 ntTSL 216.87■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PDIA5-202ENST00000467157 2232 ntTSL 213.24□□□□□ -0.291e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 SCAMP4-207ENST00000472442 2973 ntTSL 213.01□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CHTF18-212ENST00000493715 691 ntTSL 312.4□□□□□ -0.421e-11■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 WDR59-215ENST00000568462 550 ntTSL 45.44□□□□□ -1.541e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PDIA5-203ENST00000469649 722 ntTSL 54.95□□□□□ -1.621e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 317.45■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 510.68□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 59.53□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.195e-8■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CTSZ-204ENST00000503833 955 ntTSL 1 (best)20.08■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 CTSZ-203ENST00000488395 647 ntTSL 215.58■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 TRAP1-209ENST00000574175 535 ntTSL 514.95□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 TRAP1-204ENST00000570514 412 ntTSL 28.83□□□□□ -11e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 MAST3-203ENST00000608648 1760 ntTSL 517.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 INTS10-202ENST00000517546 864 ntTSL 212.79□□□□□ -0.365e-13■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 511.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ANKS1A-202ENST00000470698 957 ntTSL 510.04□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 INTS10-216ENST00000523772 777 ntTSL 59.95□□□□□ -0.825e-13■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 MKS1-212ENST00000583577 697 ntTSL 29.01□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 INTS10-207ENST00000520827 631 ntTSL 37.56□□□□□ -1.25e-13■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 ERI3-206ENST00000462341 320 ntTSL 33.77□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 LRCH3-205ENST00000433298 977 ntTSL 56.71□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 LRCH3-209ENST00000452660 681 ntTSL 52.49□□□□□ -2.012e-9■■■■■ 32.3
SF3B4Q15427 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 210.23□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 39.82□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 37.62□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 220.4■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 513.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 412.71□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 32.2
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