Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN2CQ14957 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN2CQ14957 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms