Protein–RNA interactions for Protein: Q13239

SLA, Src-like-adapter, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAQ13239 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLAQ13239 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLAQ13239 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLAQ13239 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLAQ13239 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLAQ13239 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLAQ13239 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms