Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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