Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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