Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms