Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms