Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX1P83916 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX1P83916 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX1P83916 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX1P83916 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX1P83916 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX1P83916 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX1P83916 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX1P83916 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms