Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VBP1P61758 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VBP1P61758 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms