Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5BP61020 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5BP61020 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5BP61020 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5BP61020 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5BP61020 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5BP61020 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5BP61020 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5BP61020 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms