Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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