Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms