Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP2P42575 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP2P42575 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP2P42575 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP2P42575 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP2P42575 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP2P42575 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP2P42575 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms