Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB1P37275 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms