Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms