Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms