Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD53P19397 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD53P19397 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms