Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRB1P17538 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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