Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms